wisegeneusa K003說(shuō)明書(shū)

wisegeneusa的使命是開(kāi)發(fā)，制造和提供新型基因組測(cè)序和檢測(cè)技術(shù)的研究工具。我們將繼續(xù)許可，開(kāi)發(fā)和商業(yè)化表觀(guān)遺傳學(xué)中的新基因組測(cè)序試劑和方法。

5-羥甲基胞嘧啶是一種DNA甲基化修飾，由鐵依賴(lài)性脫氧酶的Tet家族酶促氧化5-甲基胞嘧啶（5-mC）而發(fā)生

關(guān)于我們的TAB-seq套件，請(qǐng)注意以下事項(xiàng)。

TAB-seqβGT保護(hù)效率說(shuō)明

關(guān)于我們的TAB-seq套件，請(qǐng)注意以下事項(xiàng)：

1.我們提供的5hmC加標(biāo)對(duì)照通過(guò)使用5-羥甲基胞嘧啶dNTP混合物的PCR擴(kuò)增產(chǎn)生。原則上，5hmC加標(biāo)對(duì)照中的所有胞嘧啶應(yīng)該是100％羥甲基化的。然而，由于商業(yè)化5hmdCTP的雜質(zhì)和暴露于空氣中5hmC的緩慢氧化，5hmC加標(biāo)對(duì)照中每個(gè)胞嘧啶位點(diǎn)的實(shí)際5hmC豐度約為80％。結(jié)果，即使在標(biāo)準(zhǔn)亞硫酸氫鹽測(cè)序中，5hmC加標(biāo)對(duì)照中僅80％的胞嘧啶將被讀作'C'。該數(shù)量（~80％）可能會(huì)根據(jù)5hmC加標(biāo)控制的存儲(chǔ)條件/時(shí)間而變化。

為了準(zhǔn)確評(píng)估TAB-seq中5hmC的保護(hù)率，我們建議對(duì)含有相同批次的5hmC加標(biāo)對(duì)照的一個(gè)樣品進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)亞硫酸氫鹽測(cè)序，以確定其真正的5hmC豐度。例如，如果5hmC加標(biāo)對(duì)照中80％的胞嘧啶在標(biāo)準(zhǔn)亞硫酸氫鹽測(cè)序中讀作'C'，其中70％在TAB-seq中讀作'C'，則表明您的TAB-的實(shí)際保護(hù)率seq測(cè)定應(yīng)為0.7 / 0.8 = 87.5％但不是70％。

2.在βGT保護(hù)后，當(dāng)使用某種聚合酶（例如Taq聚合酶）時(shí)，5hmC對(duì)照上的濃密5gmC可能停止聚合。為了避免可能的PCR偏差，建議將PfuTurbo Cx hotstart聚合酶（Agilent）或等同物用于文庫(kù)構(gòu)建中的終PCR擴(kuò)增步驟。

5mC Tet1氧化試劑盒

5mC Tet1 Oxidation 

目錄號(hào)：K003

單價(jià)：每件套669美元

產(chǎn)品說(shuō)明

5mC Tet1氧化試劑盒可用于將基因組DNA中的5-甲基胞嘧啶（5mC）轉(zhuǎn)化為5-羧基胞嘧啶（5caC）用于隨后的測(cè)序應(yīng)用。

每個(gè)試劑盒包含足夠的試劑，可根據(jù)推薦的方案進(jìn)行多達(dá)3個(gè)全基因組或9個(gè)基因座特異性測(cè)序反應(yīng)。

存儲(chǔ)

在抵達(dá)時(shí)在-80℃儲(chǔ)存5mC Tet1氧化試劑盒。Tet1蛋白對(duì)溫度敏感; 應(yīng)避免多次凍融。

5hmC TAB-Seq Kit

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Catalog No: K001

Unit Price: $969 / per kit

5hmC/5mC TAB-Array Kit (compatible to Infinium 450K Array)

Catalog No: K002

Unit Price: $869 / per kit

5mC Tet1 Oxidation Kit for the PacBio® RS Instrument

Catalog No: K004

Unit Price: $669 / per kit

5hmC DNA Standard

Catalog No: S002

Unit Price: $30 each

5mC DNA Standard

Catalog No: S001

Unit Price: $30 each

上海起發(fā)實(shí)驗(yàn)試劑有限公司是實(shí)驗(yàn)試劑一站式采購(gòu)服務(wù)商

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