Dovetail Genomics 是一家位于圣克魯斯的初創(chuàng)生命科學(xué)公司，致力于開發(fā)基因組學(xué)技術(shù)，以改善基因組組裝、揭示關(guān)鍵的結(jié)構(gòu)變異信息以及基因組學(xué)中的許多其他令人興奮的應(yīng)用。

dovetailgenomics 21007說明書

Dovetail™ HiChIP MNase Kit 結(jié)合了 ChIP-seq 和 Hi-C 的優(yōu)點(diǎn)，Hi-C 是一種鄰近連接方法，使用標(biāo)準(zhǔn)的 Illumina 雙端測序捕獲長距離相互作用，使研究人員能夠查詢由特定蛋白質(zhì)介導(dǎo)的蛋白質(zhì)定向染色質(zhì)構(gòu)象。興趣。
除抗體外，該試劑盒提供了在生成 NGS 文庫之前對哺乳動(dòng)物樣本進(jìn)行染色質(zhì)免疫沉淀和鄰近連接步驟所需的所有試劑。該試劑盒與用于 Illumina 的 Dovetail™ 文庫模塊（貨號(hào) #25004）和用于 Illumina 測序的第 3 方標(biāo)準(zhǔn)雙端文庫制備試劑盒兼容。

Dovetail HiChIP Kit 具有以下主要優(yōu)勢：

• 在單個(gè)庫中同時(shí)捕獲 ChIP-seq 和 Hi-C 數(shù)據(jù)

• 推出更多即用型抗體

• 以核小體水平分辨率繪制染色質(zhì)相互作用圖

從樣品到測序就緒文庫的簡單三天工作流程

與其他類似方法相比，Dovetail HiChIP 工作流程具有多項(xiàng)優(yōu)勢：

• 染色質(zhì)的酶促和均勻裂解

• 來自鄰近結(jié)扎的遠(yuǎn)程信息的豐富

• 穩(wěn)健性和重現(xiàn)性低至一百萬個(gè)細(xì)胞輸入

• 經(jīng)驗(yàn)證的常見抗體清單

Dovetail™ Micro-C Proximity Ligation Assay 與 Dovetail HiChIP 方法的*組合使使用微球菌核酸酶 ( MNase ) 能夠在鄰近連接之前均勻地分割染色質(zhì)，沒有序列偏差，消除了對精細(xì)超聲處理程序的需要，并提供了染色質(zhì)相互作用的最大分辨率（低至單核小體大小）。

繪制蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)和長程蛋白質(zhì)定向相互作用

Dovetail HiChIP Kit 能夠研究蛋白質(zhì)導(dǎo)向的 3-D 染色質(zhì)相互作用。與 ChIP-seq 類似，Dovetail HiChIP 數(shù)據(jù)捕獲由目標(biāo)蛋白質(zhì)直接結(jié)合的序列。然而，還捕獲了由感興趣的蛋白質(zhì)介導(dǎo)的其他遠(yuǎn)程相互作用。在測定中使用MNase 會(huì)產(chǎn)生核小體分辨率數(shù)據(jù)。

以較少的順序生成高分辨率的接觸圖

蛋白質(zhì)導(dǎo)向染色質(zhì)特征的富集使高分辨率接觸圖生成成為可能，但讀取深度更小。與基于高分辨率限制性內(nèi)切酶的 Hi-C 相比，Dovetail HiChIP 數(shù)據(jù)能夠以讀取深度的一小部分顯示高階染色質(zhì)特征，例如環(huán)和染色質(zhì)相互作用，從而顯著節(jié)省測序成本。